Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TROQ12816 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TROQ12816 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TROQ12816 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TROQ12816 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TROQ12816 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TROQ12816 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TROQ12816 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TROQ12816 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TROQ12816 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TROQ12816 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TROQ12816 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TROQ12816 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TROQ12816 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TROQ12816 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TROQ12816 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TROQ12816 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TROQ12816 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TROQ12816 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TROQ12816 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TROQ12816 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TROQ12816 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TROQ12816 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TROQ12816 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TROQ12816 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TROQ12816 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TROQ12816 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TROQ12816 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TROQ12816 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TROQ12816 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TROQ12816 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TROQ12816 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TROQ12816 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TROQ12816 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TROQ12816 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TROQ12816 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TROQ12816 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TROQ12816 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TROQ12816 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TROQ12816 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TROQ12816 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TROQ12816 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TROQ12816 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TROQ12816 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TROQ12816 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TROQ12816 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TROQ12816 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TROQ12816 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TROQ12816 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TROQ12816 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TROQ12816 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TROQ12816 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TROQ12816 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TROQ12816 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TROQ12816 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TROQ12816 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TROQ12816 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TROQ12816 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TROQ12816 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TROQ12816 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TROQ12816 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TROQ12816 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TROQ12816 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TROQ12816 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TROQ12816 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TROQ12816 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TROQ12816 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TROQ12816 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TROQ12816 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TROQ12816 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TROQ12816 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TROQ12816 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TROQ12816 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TROQ12816 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TROQ12816 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TROQ12816 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TROQ12816 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TROQ12816 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TROQ12816 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TROQ12816 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TROQ12816 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TROQ12816 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TROQ12816 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TROQ12816 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TROQ12816 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TROQ12816 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TROQ12816 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TROQ12816 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TROQ12816 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TROQ12816 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TROQ12816 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TROQ12816 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TROQ12816 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TROQ12816 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TROQ12816 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TROQ12816 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TROQ12816 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TROQ12816 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TROQ12816 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TROQ12816 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
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