Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
APOBRQ0VD83 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms