Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms