Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM27E3Q08E93 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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