Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GOLGA3Q08378 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC27■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC27■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC27■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC27■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC27■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC27■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC27■■□□□ 1.91
GOLGA3Q08378 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms