Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBQ06643 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBQ06643 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBQ06643 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBQ06643 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBQ06643 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBQ06643 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBQ06643 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBQ06643 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBQ06643 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBQ06643 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBQ06643 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBQ06643 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBQ06643 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBQ06643 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBQ06643 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBQ06643 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBQ06643 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBQ06643 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBQ06643 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBQ06643 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBQ06643 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBQ06643 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBQ06643 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBQ06643 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBQ06643 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBQ06643 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBQ06643 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBQ06643 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBQ06643 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBQ06643 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBQ06643 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBQ06643 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBQ06643 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBQ06643 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBQ06643 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBQ06643 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBQ06643 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBQ06643 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBQ06643 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBQ06643 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBQ06643 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBQ06643 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBQ06643 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBQ06643 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBQ06643 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBQ06643 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBQ06643 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBQ06643 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBQ06643 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBQ06643 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LTBQ06643 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LTBQ06643 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LTBQ06643 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LTBQ06643 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LTBQ06643 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LTBQ06643 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LTBQ06643 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LTBQ06643 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LTBQ06643 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LTBQ06643 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LTBQ06643 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LTBQ06643 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LTBQ06643 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LTBQ06643 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LTBQ06643 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LTBQ06643 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LTBQ06643 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LTBQ06643 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LTBQ06643 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LTBQ06643 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LTBQ06643 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LTBQ06643 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LTBQ06643 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LTBQ06643 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LTBQ06643 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LTBQ06643 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LTBQ06643 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LTBQ06643 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LTBQ06643 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LTBQ06643 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LTBQ06643 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LTBQ06643 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LTBQ06643 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LTBQ06643 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LTBQ06643 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LTBQ06643 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LTBQ06643 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LTBQ06643 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LTBQ06643 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LTBQ06643 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LTBQ06643 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LTBQ06643 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LTBQ06643 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LTBQ06643 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LTBQ06643 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LTBQ06643 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LTBQ06643 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LTBQ06643 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LTBQ06643 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms