Protein–RNA interactions for Protein: Q06141

REG3A, Regenerating islet-derived protein 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG3AQ06141 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC11.56□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
REG3AQ06141 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms