Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms