Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GBE1Q04446 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GBE1Q04446 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms