Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms