Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms