Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD3P84022 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms