Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SIM1P81133 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIM1P81133 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIM1P81133 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIM1P81133 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIM1P81133 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIM1P81133 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIM1P81133 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SIM1P81133 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIM1P81133 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIM1P81133 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SIM1P81133 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIM1P81133 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIM1P81133 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIM1P81133 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SIM1P81133 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SIM1P81133 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIM1P81133 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIM1P81133 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIM1P81133 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIM1P81133 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIM1P81133 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIM1P81133 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIM1P81133 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIM1P81133 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIM1P81133 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIM1P81133 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIM1P81133 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIM1P81133 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIM1P81133 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIM1P81133 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIM1P81133 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIM1P81133 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIM1P81133 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SIM1P81133 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIM1P81133 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIM1P81133 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIM1P81133 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIM1P81133 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIM1P81133 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIM1P81133 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIM1P81133 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIM1P81133 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIM1P81133 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIM1P81133 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIM1P81133 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIM1P81133 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIM1P81133 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIM1P81133 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIM1P81133 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SIM1P81133 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIM1P81133 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIM1P81133 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIM1P81133 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIM1P81133 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIM1P81133 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIM1P81133 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SIM1P81133 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIM1P81133 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SIM1P81133 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIM1P81133 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIM1P81133 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIM1P81133 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIM1P81133 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIM1P81133 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIM1P81133 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIM1P81133 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIM1P81133 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIM1P81133 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIM1P81133 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIM1P81133 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SIM1P81133 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIM1P81133 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIM1P81133 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIM1P81133 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIM1P81133 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIM1P81133 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIM1P81133 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIM1P81133 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIM1P81133 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIM1P81133 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIM1P81133 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIM1P81133 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIM1P81133 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIM1P81133 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIM1P81133 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIM1P81133 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIM1P81133 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIM1P81133 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIM1P81133 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIM1P81133 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIM1P81133 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIM1P81133 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SIM1P81133 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SIM1P81133 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SIM1P81133 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIM1P81133 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIM1P81133 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIM1P81133 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIM1P81133 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms