Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRX1P78414 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRX1P78414 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRX1P78414 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRX1P78414 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRX1P78414 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRX1P78414 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRX1P78414 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
IRX1P78414 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
IRX1P78414 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRX1P78414 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
IRX1P78414 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRX1P78414 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRX1P78414 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRX1P78414 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRX1P78414 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRX1P78414 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRX1P78414 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRX1P78414 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRX1P78414 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRX1P78414 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRX1P78414 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRX1P78414 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRX1P78414 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRX1P78414 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRX1P78414 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRX1P78414 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRX1P78414 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRX1P78414 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRX1P78414 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRX1P78414 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRX1P78414 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRX1P78414 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRX1P78414 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRX1P78414 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRX1P78414 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRX1P78414 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRX1P78414 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRX1P78414 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRX1P78414 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRX1P78414 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRX1P78414 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRX1P78414 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
IRX1P78414 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
IRX1P78414 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRX1P78414 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRX1P78414 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRX1P78414 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRX1P78414 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRX1P78414 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRX1P78414 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRX1P78414 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRX1P78414 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRX1P78414 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRX1P78414 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRX1P78414 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRX1P78414 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRX1P78414 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRX1P78414 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRX1P78414 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
IRX1P78414 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRX1P78414 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRX1P78414 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRX1P78414 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRX1P78414 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRX1P78414 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
IRX1P78414 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRX1P78414 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRX1P78414 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRX1P78414 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRX1P78414 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRX1P78414 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRX1P78414 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRX1P78414 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRX1P78414 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRX1P78414 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRX1P78414 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRX1P78414 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRX1P78414 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
IRX1P78414 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRX1P78414 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRX1P78414 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRX1P78414 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRX1P78414 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
IRX1P78414 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRX1P78414 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRX1P78414 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRX1P78414 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRX1P78414 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRX1P78414 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRX1P78414 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRX1P78414 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRX1P78414 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRX1P78414 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRX1P78414 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRX1P78414 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRX1P78414 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRX1P78414 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRX1P78414 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRX1P78414 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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