Protein–RNA interactions for Protein: P59190

RAB15, Ras-related protein Rab-15, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB15P59190 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB15P59190 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB15P59190 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB15P59190 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB15P59190 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB15P59190 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB15P59190 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB15P59190 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB15P59190 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB15P59190 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB15P59190 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB15P59190 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB15P59190 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB15P59190 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB15P59190 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB15P59190 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB15P59190 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB15P59190 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB15P59190 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB15P59190 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB15P59190 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB15P59190 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB15P59190 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB15P59190 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB15P59190 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB15P59190 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB15P59190 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB15P59190 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB15P59190 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB15P59190 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB15P59190 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB15P59190 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB15P59190 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB15P59190 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB15P59190 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB15P59190 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB15P59190 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB15P59190 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB15P59190 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB15P59190 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB15P59190 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB15P59190 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB15P59190 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB15P59190 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB15P59190 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB15P59190 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB15P59190 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB15P59190 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB15P59190 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB15P59190 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB15P59190 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB15P59190 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB15P59190 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB15P59190 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB15P59190 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB15P59190 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB15P59190 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB15P59190 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB15P59190 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB15P59190 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB15P59190 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB15P59190 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB15P59190 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB15P59190 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB15P59190 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB15P59190 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB15P59190 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB15P59190 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB15P59190 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB15P59190 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB15P59190 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB15P59190 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB15P59190 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB15P59190 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB15P59190 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB15P59190 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB15P59190 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB15P59190 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB15P59190 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB15P59190 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB15P59190 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB15P59190 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB15P59190 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB15P59190 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB15P59190 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB15P59190 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB15P59190 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB15P59190 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB15P59190 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB15P59190 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB15P59190 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB15P59190 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB15P59190 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB15P59190 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB15P59190 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB15P59190 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB15P59190 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB15P59190 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB15P59190 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB15P59190 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms