Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3BP58499 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms