Protein–RNA interactions for Protein: P57775

FBXW4, F-box/WD repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW4P57775 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FBXW4P57775 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms