Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP6P55212 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP6P55212 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP6P55212 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP6P55212 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP6P55212 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP6P55212 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP6P55212 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP6P55212 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP6P55212 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP6P55212 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP6P55212 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP6P55212 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP6P55212 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP6P55212 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP6P55212 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP6P55212 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP6P55212 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP6P55212 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP6P55212 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP6P55212 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP6P55212 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP6P55212 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP6P55212 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP6P55212 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP6P55212 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP6P55212 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP6P55212 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP6P55212 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP6P55212 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP6P55212 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP6P55212 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP6P55212 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP6P55212 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP6P55212 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP6P55212 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP6P55212 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP6P55212 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP6P55212 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP6P55212 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP6P55212 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP6P55212 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP6P55212 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP6P55212 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP6P55212 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP6P55212 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP6P55212 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP6P55212 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP6P55212 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP6P55212 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP6P55212 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP6P55212 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP6P55212 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP6P55212 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP6P55212 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP6P55212 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP6P55212 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP6P55212 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP6P55212 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP6P55212 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP6P55212 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP6P55212 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP6P55212 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP6P55212 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP6P55212 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP6P55212 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP6P55212 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP6P55212 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP6P55212 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP6P55212 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP6P55212 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP6P55212 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP6P55212 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP6P55212 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP6P55212 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP6P55212 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP6P55212 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP6P55212 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP6P55212 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP6P55212 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP6P55212 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP6P55212 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP6P55212 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP6P55212 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP6P55212 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP6P55212 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP6P55212 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP6P55212 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP6P55212 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP6P55212 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP6P55212 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP6P55212 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP6P55212 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP6P55212 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP6P55212 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP6P55212 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP6P55212 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP6P55212 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP6P55212 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CASP6P55212 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms