Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SMARCA2P51531 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms