Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms