Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP153P49790 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP153P49790 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP153P49790 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP153P49790 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP153P49790 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP153P49790 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP153P49790 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP153P49790 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP153P49790 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP153P49790 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP153P49790 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP153P49790 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP153P49790 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP153P49790 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP153P49790 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP153P49790 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP153P49790 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP153P49790 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP153P49790 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP153P49790 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP153P49790 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP153P49790 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP153P49790 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP153P49790 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP153P49790 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP153P49790 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP153P49790 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP153P49790 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP153P49790 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP153P49790 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP153P49790 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP153P49790 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP153P49790 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP153P49790 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP153P49790 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP153P49790 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP153P49790 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP153P49790 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP153P49790 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP153P49790 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP153P49790 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP153P49790 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP153P49790 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP153P49790 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP153P49790 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP153P49790 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP153P49790 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP153P49790 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP153P49790 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP153P49790 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP153P49790 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP153P49790 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP153P49790 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP153P49790 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP153P49790 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP153P49790 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP153P49790 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP153P49790 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP153P49790 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP153P49790 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP153P49790 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP153P49790 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NUP153P49790 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NUP153P49790 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NUP153P49790 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NUP153P49790 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP153P49790 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP153P49790 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP153P49790 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP153P49790 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP153P49790 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP153P49790 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP153P49790 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP153P49790 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP153P49790 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP153P49790 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP153P49790 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP153P49790 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP153P49790 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP153P49790 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP153P49790 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP153P49790 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP153P49790 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP153P49790 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP153P49790 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP153P49790 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP153P49790 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP153P49790 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP153P49790 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP153P49790 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP153P49790 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP153P49790 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP153P49790 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP153P49790 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP153P49790 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP153P49790 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP153P49790 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP153P49790 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP153P49790 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms