Protein–RNA interactions for Protein: P49418

AMPH, Amphiphysin, humanhuman

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPHP49418 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AMPHP49418 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AMPHP49418 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AMPHP49418 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
AMPHP49418 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
AMPHP49418 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
AMPHP49418 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
AMPHP49418 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
AMPHP49418 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AMPHP49418 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AMPHP49418 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AMPHP49418 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AMPHP49418 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AMPHP49418 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AMPHP49418 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AMPHP49418 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AMPHP49418 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AMPHP49418 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AMPHP49418 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AMPHP49418 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMPHP49418 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMPHP49418 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMPHP49418 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMPHP49418 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMPHP49418 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMPHP49418 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMPHP49418 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMPHP49418 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMPHP49418 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMPHP49418 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMPHP49418 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMPHP49418 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
AMPHP49418 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMPHP49418 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMPHP49418 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMPHP49418 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMPHP49418 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
AMPHP49418 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMPHP49418 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMPHP49418 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMPHP49418 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMPHP49418 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMPHP49418 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
AMPHP49418 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
AMPHP49418 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMPHP49418 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMPHP49418 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMPHP49418 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMPHP49418 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMPHP49418 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
AMPHP49418 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
AMPHP49418 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
AMPHP49418 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMPHP49418 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMPHP49418 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMPHP49418 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMPHP49418 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMPHP49418 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMPHP49418 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMPHP49418 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMPHP49418 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMPHP49418 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMPHP49418 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMPHP49418 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMPHP49418 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMPHP49418 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMPHP49418 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
AMPHP49418 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMPHP49418 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
AMPHP49418 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMPHP49418 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMPHP49418 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMPHP49418 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMPHP49418 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMPHP49418 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMPHP49418 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMPHP49418 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMPHP49418 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMPHP49418 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMPHP49418 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMPHP49418 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMPHP49418 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMPHP49418 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMPHP49418 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AMPHP49418 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AMPHP49418 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AMPHP49418 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AMPHP49418 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AMPHP49418 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AMPHP49418 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AMPHP49418 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AMPHP49418 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AMPHP49418 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AMPHP49418 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
AMPHP49418 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AMPHP49418 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
AMPHP49418 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AMPHP49418 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AMPHP49418 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AMPHP49418 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms