Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CDKN1BP46527 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms