Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSR1P43307 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSR1P43307 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSR1P43307 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSR1P43307 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSR1P43307 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSR1P43307 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSR1P43307 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSR1P43307 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSR1P43307 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSR1P43307 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSR1P43307 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSR1P43307 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SSR1P43307 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSR1P43307 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSR1P43307 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSR1P43307 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSR1P43307 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSR1P43307 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SSR1P43307 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSR1P43307 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSR1P43307 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSR1P43307 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSR1P43307 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSR1P43307 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSR1P43307 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSR1P43307 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSR1P43307 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSR1P43307 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSR1P43307 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSR1P43307 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSR1P43307 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSR1P43307 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSR1P43307 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSR1P43307 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSR1P43307 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC18■□□□□ 0.47
SSR1P43307 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SSR1P43307 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSR1P43307 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSR1P43307 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SSR1P43307 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSR1P43307 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SSR1P43307 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SSR1P43307 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSR1P43307 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSR1P43307 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSR1P43307 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SSR1P43307 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SSR1P43307 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SSR1P43307 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSR1P43307 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSR1P43307 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSR1P43307 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSR1P43307 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSR1P43307 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SSR1P43307 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SSR1P43307 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSR1P43307 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSR1P43307 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSR1P43307 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSR1P43307 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSR1P43307 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSR1P43307 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSR1P43307 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSR1P43307 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSR1P43307 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSR1P43307 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSR1P43307 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSR1P43307 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSR1P43307 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSR1P43307 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSR1P43307 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSR1P43307 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSR1P43307 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSR1P43307 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSR1P43307 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSR1P43307 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSR1P43307 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSR1P43307 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SSR1P43307 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SSR1P43307 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSR1P43307 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSR1P43307 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSR1P43307 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSR1P43307 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSR1P43307 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSR1P43307 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSR1P43307 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSR1P43307 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSR1P43307 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSR1P43307 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSR1P43307 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SSR1P43307 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSR1P43307 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSR1P43307 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSR1P43307 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSR1P43307 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSR1P43307 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSR1P43307 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSR1P43307 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms