Protein–RNA interactions for Protein: P36871

PGM1, Phosphoglucomutase-1, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGM1P36871 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGM1P36871 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGM1P36871 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGM1P36871 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGM1P36871 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGM1P36871 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGM1P36871 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PGM1P36871 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGM1P36871 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGM1P36871 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGM1P36871 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGM1P36871 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGM1P36871 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGM1P36871 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGM1P36871 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGM1P36871 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGM1P36871 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGM1P36871 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGM1P36871 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGM1P36871 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGM1P36871 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGM1P36871 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGM1P36871 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGM1P36871 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGM1P36871 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGM1P36871 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGM1P36871 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGM1P36871 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGM1P36871 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGM1P36871 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGM1P36871 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGM1P36871 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGM1P36871 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGM1P36871 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGM1P36871 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGM1P36871 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGM1P36871 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGM1P36871 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGM1P36871 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGM1P36871 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGM1P36871 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGM1P36871 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGM1P36871 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGM1P36871 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGM1P36871 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGM1P36871 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGM1P36871 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGM1P36871 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGM1P36871 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGM1P36871 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGM1P36871 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGM1P36871 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGM1P36871 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PGM1P36871 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGM1P36871 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGM1P36871 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGM1P36871 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGM1P36871 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGM1P36871 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGM1P36871 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGM1P36871 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGM1P36871 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGM1P36871 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGM1P36871 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGM1P36871 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGM1P36871 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGM1P36871 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PGM1P36871 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGM1P36871 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGM1P36871 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGM1P36871 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGM1P36871 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGM1P36871 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGM1P36871 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGM1P36871 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGM1P36871 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGM1P36871 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGM1P36871 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGM1P36871 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGM1P36871 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGM1P36871 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGM1P36871 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGM1P36871 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PGM1P36871 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PGM1P36871 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGM1P36871 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGM1P36871 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGM1P36871 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGM1P36871 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGM1P36871 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGM1P36871 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PGM1P36871 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGM1P36871 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGM1P36871 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGM1P36871 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGM1P36871 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGM1P36871 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGM1P36871 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGM1P36871 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGM1P36871 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms