Protein–RNA interactions for Protein: P35916

FLT4, Vascular endothelial growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT4P35916 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FLT4P35916 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FLT4P35916 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FLT4P35916 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FLT4P35916 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FLT4P35916 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FLT4P35916 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FLT4P35916 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FLT4P35916 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FLT4P35916 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FLT4P35916 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FLT4P35916 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FLT4P35916 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FLT4P35916 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FLT4P35916 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FLT4P35916 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FLT4P35916 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FLT4P35916 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FLT4P35916 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FLT4P35916 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FLT4P35916 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FLT4P35916 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FLT4P35916 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FLT4P35916 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FLT4P35916 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FLT4P35916 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FLT4P35916 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FLT4P35916 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FLT4P35916 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FLT4P35916 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FLT4P35916 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FLT4P35916 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FLT4P35916 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FLT4P35916 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FLT4P35916 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FLT4P35916 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FLT4P35916 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FLT4P35916 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FLT4P35916 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FLT4P35916 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FLT4P35916 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FLT4P35916 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FLT4P35916 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FLT4P35916 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FLT4P35916 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FLT4P35916 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FLT4P35916 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FLT4P35916 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FLT4P35916 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FLT4P35916 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FLT4P35916 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FLT4P35916 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FLT4P35916 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FLT4P35916 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FLT4P35916 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FLT4P35916 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FLT4P35916 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FLT4P35916 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FLT4P35916 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FLT4P35916 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FLT4P35916 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FLT4P35916 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FLT4P35916 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FLT4P35916 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FLT4P35916 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FLT4P35916 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FLT4P35916 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FLT4P35916 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FLT4P35916 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FLT4P35916 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FLT4P35916 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FLT4P35916 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FLT4P35916 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FLT4P35916 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FLT4P35916 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FLT4P35916 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FLT4P35916 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FLT4P35916 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FLT4P35916 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FLT4P35916 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FLT4P35916 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FLT4P35916 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FLT4P35916 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FLT4P35916 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FLT4P35916 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FLT4P35916 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FLT4P35916 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FLT4P35916 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FLT4P35916 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FLT4P35916 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FLT4P35916 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FLT4P35916 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FLT4P35916 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FLT4P35916 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FLT4P35916 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FLT4P35916 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FLT4P35916 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FLT4P35916 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FLT4P35916 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FLT4P35916 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms