Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA7P31268 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXA7P31268 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXA7P31268 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXA7P31268 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXA7P31268 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXA7P31268 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXA7P31268 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXA7P31268 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXA7P31268 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXA7P31268 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXA7P31268 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms