Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCAP28676 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCAP28676 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GCAP28676 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCAP28676 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCAP28676 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCAP28676 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCAP28676 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCAP28676 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCAP28676 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCAP28676 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GCAP28676 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCAP28676 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCAP28676 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCAP28676 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCAP28676 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCAP28676 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCAP28676 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GCAP28676 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCAP28676 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCAP28676 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCAP28676 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCAP28676 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCAP28676 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCAP28676 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCAP28676 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCAP28676 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCAP28676 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCAP28676 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCAP28676 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCAP28676 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCAP28676 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCAP28676 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCAP28676 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCAP28676 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCAP28676 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCAP28676 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCAP28676 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCAP28676 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCAP28676 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCAP28676 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCAP28676 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCAP28676 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCAP28676 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCAP28676 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCAP28676 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCAP28676 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCAP28676 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GCAP28676 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCAP28676 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCAP28676 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCAP28676 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCAP28676 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCAP28676 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCAP28676 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCAP28676 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GCAP28676 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCAP28676 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCAP28676 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCAP28676 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCAP28676 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCAP28676 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GCAP28676 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCAP28676 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCAP28676 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCAP28676 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCAP28676 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCAP28676 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCAP28676 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCAP28676 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCAP28676 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCAP28676 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCAP28676 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCAP28676 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCAP28676 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCAP28676 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCAP28676 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCAP28676 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCAP28676 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GCAP28676 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCAP28676 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GCAP28676 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCAP28676 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCAP28676 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCAP28676 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCAP28676 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCAP28676 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCAP28676 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCAP28676 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCAP28676 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCAP28676 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCAP28676 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GCAP28676 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCAP28676 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GCAP28676 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GCAP28676 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GCAP28676 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCAP28676 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCAP28676 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GCAP28676 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms