Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PEX2P28328 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PEX2P28328 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PEX2P28328 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PEX2P28328 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PEX2P28328 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PEX2P28328 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PEX2P28328 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PEX2P28328 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PEX2P28328 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PEX2P28328 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PEX2P28328 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PEX2P28328 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PEX2P28328 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PEX2P28328 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PEX2P28328 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PEX2P28328 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PEX2P28328 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PEX2P28328 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PEX2P28328 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PEX2P28328 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PEX2P28328 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PEX2P28328 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PEX2P28328 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PEX2P28328 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PEX2P28328 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PEX2P28328 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PEX2P28328 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PEX2P28328 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PEX2P28328 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PEX2P28328 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PEX2P28328 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PEX2P28328 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PEX2P28328 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PEX2P28328 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PEX2P28328 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PEX2P28328 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PEX2P28328 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PEX2P28328 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PEX2P28328 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PEX2P28328 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PEX2P28328 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PEX2P28328 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PEX2P28328 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PEX2P28328 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PEX2P28328 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PEX2P28328 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PEX2P28328 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PEX2P28328 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PEX2P28328 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PEX2P28328 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PEX2P28328 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PEX2P28328 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PEX2P28328 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PEX2P28328 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PEX2P28328 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PEX2P28328 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PEX2P28328 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PEX2P28328 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PEX2P28328 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PEX2P28328 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PEX2P28328 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PEX2P28328 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PEX2P28328 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PEX2P28328 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PEX2P28328 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PEX2P28328 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PEX2P28328 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PEX2P28328 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PEX2P28328 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PEX2P28328 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX2P28328 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX2P28328 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX2P28328 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX2P28328 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX2P28328 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX2P28328 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX2P28328 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX2P28328 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX2P28328 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX2P28328 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX2P28328 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX2P28328 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX2P28328 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX2P28328 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX2P28328 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX2P28328 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX2P28328 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX2P28328 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX2P28328 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX2P28328 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX2P28328 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX2P28328 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX2P28328 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX2P28328 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX2P28328 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX2P28328 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX2P28328 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX2P28328 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PEX2P28328 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms