Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSFA2P28290 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms