Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms