Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms