Protein–RNA interactions for Protein: P22888

LHCGR, Lutropin-choriogonadotropic hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHCGRP22888 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHCGRP22888 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHCGRP22888 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHCGRP22888 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHCGRP22888 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHCGRP22888 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHCGRP22888 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHCGRP22888 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHCGRP22888 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHCGRP22888 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHCGRP22888 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHCGRP22888 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHCGRP22888 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHCGRP22888 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHCGRP22888 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHCGRP22888 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHCGRP22888 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LHCGRP22888 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHCGRP22888 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHCGRP22888 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LHCGRP22888 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHCGRP22888 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHCGRP22888 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LHCGRP22888 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHCGRP22888 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LHCGRP22888 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHCGRP22888 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHCGRP22888 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHCGRP22888 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHCGRP22888 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHCGRP22888 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHCGRP22888 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHCGRP22888 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHCGRP22888 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHCGRP22888 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHCGRP22888 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHCGRP22888 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHCGRP22888 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHCGRP22888 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHCGRP22888 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHCGRP22888 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHCGRP22888 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHCGRP22888 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHCGRP22888 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHCGRP22888 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHCGRP22888 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHCGRP22888 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHCGRP22888 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHCGRP22888 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHCGRP22888 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LHCGRP22888 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHCGRP22888 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHCGRP22888 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHCGRP22888 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHCGRP22888 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHCGRP22888 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHCGRP22888 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHCGRP22888 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHCGRP22888 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHCGRP22888 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHCGRP22888 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LHCGRP22888 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHCGRP22888 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHCGRP22888 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHCGRP22888 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHCGRP22888 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHCGRP22888 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHCGRP22888 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHCGRP22888 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHCGRP22888 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LHCGRP22888 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHCGRP22888 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHCGRP22888 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHCGRP22888 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHCGRP22888 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms