Protein–RNA interactions for Protein: P22736

NR4A1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A1P22736 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms