Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NTF3P20783 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
NTF3P20783 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NTF3P20783 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NTF3P20783 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NTF3P20783 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NTF3P20783 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NTF3P20783 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NTF3P20783 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NTF3P20783 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NTF3P20783 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NTF3P20783 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
NTF3P20783 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NTF3P20783 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NTF3P20783 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NTF3P20783 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NTF3P20783 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NTF3P20783 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NTF3P20783 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NTF3P20783 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NTF3P20783 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NTF3P20783 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NTF3P20783 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NTF3P20783 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NTF3P20783 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NTF3P20783 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NTF3P20783 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NTF3P20783 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NTF3P20783 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NTF3P20783 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
NTF3P20783 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NTF3P20783 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NTF3P20783 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NTF3P20783 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NTF3P20783 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NTF3P20783 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NTF3P20783 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NTF3P20783 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NTF3P20783 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
NTF3P20783 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NTF3P20783 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NTF3P20783 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NTF3P20783 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NTF3P20783 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NTF3P20783 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NTF3P20783 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NTF3P20783 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NTF3P20783 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
NTF3P20783 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
NTF3P20783 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
NTF3P20783 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
NTF3P20783 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NTF3P20783 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NTF3P20783 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NTF3P20783 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NTF3P20783 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NTF3P20783 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NTF3P20783 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NTF3P20783 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NTF3P20783 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NTF3P20783 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NTF3P20783 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NTF3P20783 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NTF3P20783 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NTF3P20783 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NTF3P20783 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
NTF3P20783 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NTF3P20783 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
NTF3P20783 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NTF3P20783 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NTF3P20783 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NTF3P20783 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NTF3P20783 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
NTF3P20783 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NTF3P20783 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NTF3P20783 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NTF3P20783 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NTF3P20783 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NTF3P20783 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NTF3P20783 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NTF3P20783 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NTF3P20783 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NTF3P20783 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NTF3P20783 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NTF3P20783 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NTF3P20783 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NTF3P20783 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NTF3P20783 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NTF3P20783 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NTF3P20783 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NTF3P20783 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NTF3P20783 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NTF3P20783 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NTF3P20783 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NTF3P20783 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NTF3P20783 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NTF3P20783 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
NTF3P20783 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NTF3P20783 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NTF3P20783 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms