Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CXCL2P19875 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms