Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
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PTPRAP18433 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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PTPRAP18433 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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PTPRAP18433 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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PTPRAP18433 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
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PTPRAP18433 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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PTPRAP18433 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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PTPRAP18433 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
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PTPRAP18433 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
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PTPRAP18433 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
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