Protein–RNA interactions for Protein: P05408

SCG5, Neuroendocrine protein 7B2, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG5P05408 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG5P05408 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG5P05408 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG5P05408 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG5P05408 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG5P05408 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG5P05408 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG5P05408 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG5P05408 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG5P05408 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG5P05408 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG5P05408 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG5P05408 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG5P05408 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG5P05408 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG5P05408 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG5P05408 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG5P05408 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG5P05408 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG5P05408 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG5P05408 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG5P05408 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG5P05408 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG5P05408 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG5P05408 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG5P05408 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG5P05408 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG5P05408 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG5P05408 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG5P05408 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG5P05408 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG5P05408 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG5P05408 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG5P05408 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCG5P05408 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG5P05408 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG5P05408 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG5P05408 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG5P05408 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG5P05408 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG5P05408 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG5P05408 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG5P05408 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG5P05408 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG5P05408 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG5P05408 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG5P05408 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG5P05408 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG5P05408 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG5P05408 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG5P05408 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG5P05408 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG5P05408 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG5P05408 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG5P05408 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG5P05408 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG5P05408 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG5P05408 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG5P05408 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG5P05408 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG5P05408 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG5P05408 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG5P05408 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG5P05408 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG5P05408 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG5P05408 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG5P05408 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG5P05408 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG5P05408 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG5P05408 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG5P05408 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG5P05408 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG5P05408 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG5P05408 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG5P05408 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG5P05408 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCG5P05408 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCG5P05408 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCG5P05408 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCG5P05408 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCG5P05408 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCG5P05408 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCG5P05408 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCG5P05408 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCG5P05408 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SCG5P05408 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCG5P05408 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCG5P05408 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SCG5P05408 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCG5P05408 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCG5P05408 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCG5P05408 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCG5P05408 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCG5P05408 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCG5P05408 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCG5P05408 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCG5P05408 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCG5P05408 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCG5P05408 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCG5P05408 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms