Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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