Protein–RNA interactions for Protein: P01854

IGHE, Immunoglobulin heavy constant epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHEP01854 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHEP01854 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHEP01854 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHEP01854 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHEP01854 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHEP01854 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHEP01854 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHEP01854 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHEP01854 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHEP01854 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHEP01854 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHEP01854 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHEP01854 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHEP01854 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHEP01854 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHEP01854 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHEP01854 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHEP01854 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHEP01854 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHEP01854 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHEP01854 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHEP01854 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHEP01854 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHEP01854 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHEP01854 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHEP01854 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHEP01854 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHEP01854 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHEP01854 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHEP01854 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHEP01854 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHEP01854 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHEP01854 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHEP01854 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHEP01854 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHEP01854 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHEP01854 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHEP01854 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHEP01854 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHEP01854 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHEP01854 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHEP01854 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHEP01854 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHEP01854 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHEP01854 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHEP01854 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHEP01854 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHEP01854 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHEP01854 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHEP01854 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHEP01854 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHEP01854 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHEP01854 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHEP01854 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHEP01854 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHEP01854 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHEP01854 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHEP01854 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHEP01854 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHEP01854 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHEP01854 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHEP01854 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHEP01854 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHEP01854 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHEP01854 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHEP01854 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHEP01854 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHEP01854 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHEP01854 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHEP01854 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHEP01854 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHEP01854 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHEP01854 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHEP01854 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHEP01854 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHEP01854 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHEP01854 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHEP01854 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHEP01854 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHEP01854 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHEP01854 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHEP01854 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHEP01854 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHEP01854 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHEP01854 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHEP01854 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHEP01854 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHEP01854 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHEP01854 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHEP01854 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHEP01854 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHEP01854 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHEP01854 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHEP01854 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHEP01854 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHEP01854 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHEP01854 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHEP01854 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHEP01854 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHEP01854 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms