Protein–RNA interactions for Protein: O60811

PRAMEF2, PRAME family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF2O60811 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRAMEF2O60811 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF2O60811 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF2O60811 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF2O60811 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF2O60811 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF2O60811 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF2O60811 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF2O60811 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF2O60811 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRAMEF2O60811 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms