Protein–RNA interactions for Protein: O60613

SELENOF, Selenoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOFO60613 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SELENOFO60613 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SELENOFO60613 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SELENOFO60613 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SELENOFO60613 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SELENOFO60613 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SELENOFO60613 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SELENOFO60613 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SELENOFO60613 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SELENOFO60613 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SELENOFO60613 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SELENOFO60613 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SELENOFO60613 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SELENOFO60613 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SELENOFO60613 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SELENOFO60613 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SELENOFO60613 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SELENOFO60613 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SELENOFO60613 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SELENOFO60613 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SELENOFO60613 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SELENOFO60613 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SELENOFO60613 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SELENOFO60613 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SELENOFO60613 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SELENOFO60613 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SELENOFO60613 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SELENOFO60613 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SELENOFO60613 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SELENOFO60613 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SELENOFO60613 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SELENOFO60613 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SELENOFO60613 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SELENOFO60613 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SELENOFO60613 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SELENOFO60613 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SELENOFO60613 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SELENOFO60613 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SELENOFO60613 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SELENOFO60613 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SELENOFO60613 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SELENOFO60613 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SELENOFO60613 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SELENOFO60613 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SELENOFO60613 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SELENOFO60613 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SELENOFO60613 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SELENOFO60613 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SELENOFO60613 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SELENOFO60613 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SELENOFO60613 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SELENOFO60613 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SELENOFO60613 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SELENOFO60613 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SELENOFO60613 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SELENOFO60613 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SELENOFO60613 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SELENOFO60613 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SELENOFO60613 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SELENOFO60613 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SELENOFO60613 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SELENOFO60613 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SELENOFO60613 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SELENOFO60613 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SELENOFO60613 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SELENOFO60613 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SELENOFO60613 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SELENOFO60613 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SELENOFO60613 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SELENOFO60613 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SELENOFO60613 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SELENOFO60613 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SELENOFO60613 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SELENOFO60613 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SELENOFO60613 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SELENOFO60613 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SELENOFO60613 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SELENOFO60613 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SELENOFO60613 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SELENOFO60613 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SELENOFO60613 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SELENOFO60613 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SELENOFO60613 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SELENOFO60613 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SELENOFO60613 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SELENOFO60613 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SELENOFO60613 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SELENOFO60613 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SELENOFO60613 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SELENOFO60613 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SELENOFO60613 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SELENOFO60613 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SELENOFO60613 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SELENOFO60613 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SELENOFO60613 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SELENOFO60613 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SELENOFO60613 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SELENOFO60613 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SELENOFO60613 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SELENOFO60613 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms