Protein–RNA interactions for Protein: O15265

ATXN7, Ataxin-7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN7O15265 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN7O15265 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms