Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SYNJ2O15056 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYNJ2O15056 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYNJ2O15056 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYNJ2O15056 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYNJ2O15056 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYNJ2O15056 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYNJ2O15056 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYNJ2O15056 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYNJ2O15056 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYNJ2O15056 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYNJ2O15056 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYNJ2O15056 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYNJ2O15056 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYNJ2O15056 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYNJ2O15056 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYNJ2O15056 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms