Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
O00370 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18■□□□□ 0.47
O00370 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
O00370 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
O00370 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
O00370 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
O00370 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
O00370 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
O00370 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
O00370 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
O00370 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
O00370 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
O00370 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
O00370 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
O00370 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
O00370 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
O00370 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
O00370 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
O00370 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
O00370 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
O00370 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
O00370 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
O00370 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
O00370 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
O00370 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
O00370 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
O00370 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
O00370 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
O00370 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
O00370 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
O00370 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
O00370 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
O00370 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
O00370 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
O00370 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
O00370 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
O00370 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
O00370 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
O00370 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
O00370 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
O00370 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
O00370 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
O00370 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
O00370 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
O00370 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
O00370 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
O00370 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
O00370 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
O00370 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
O00370 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
O00370 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
O00370 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
O00370 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
O00370 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
O00370 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
O00370 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
O00370 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
O00370 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
O00370 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
O00370 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
O00370 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
O00370 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
O00370 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
O00370 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
O00370 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
O00370 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
O00370 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
O00370 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
O00370 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
O00370 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
O00370 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
O00370 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
O00370 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
O00370 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
O00370 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
O00370 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
O00370 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
O00370 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
O00370 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
O00370 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
O00370 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
O00370 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
O00370 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
O00370 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
O00370 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
O00370 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
O00370 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
O00370 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
O00370 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
O00370 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
O00370 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
O00370 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
O00370 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
O00370 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
O00370 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
O00370 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
O00370 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
O00370 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
O00370 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
O00370 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms