Protein–RNA interactions for Protein: F8WFD2

NPIPA3, Nuclear pore complex-interacting protein family member A3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA3F8WFD2 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPA3F8WFD2 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms