Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
USP17L12C9JPN9 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
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