Protein–RNA interactions for Protein: B4E171

Tetraspanin, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E171 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4E171 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
B4E171 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4E171 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4E171 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4E171 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4E171 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4E171 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4E171 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
B4E171 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4E171 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4E171 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4E171 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4E171 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4E171 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4E171 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4E171 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4E171 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
B4E171 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4E171 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4E171 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B4E171 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
B4E171 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4E171 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4E171 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4E171 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4E171 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4E171 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4E171 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4E171 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4E171 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4E171 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4E171 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4E171 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4E171 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4E171 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4E171 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4E171 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4E171 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4E171 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4E171 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4E171 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4E171 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4E171 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4E171 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4E171 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
B4E171 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4E171 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4E171 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4E171 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4E171 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4E171 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4E171 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4E171 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4E171 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4E171 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4E171 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4E171 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4E171 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4E171 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4E171 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4E171 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4E171 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4E171 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4E171 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4E171 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4E171 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4E171 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
B4E171 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4E171 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4E171 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4E171 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4E171 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4E171 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4E171 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4E171 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4E171 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4E171 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4E171 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4E171 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
B4E171 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
B4E171 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4E171 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4E171 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4E171 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
B4E171 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
B4E171 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
B4E171 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
B4E171 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4E171 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4E171 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4E171 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4E171 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4E171 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4E171 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
B4E171 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4E171 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4E171 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4E171 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4E171 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms