Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF879B4DU55 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF879B4DU55 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms