Protein–RNA interactions for Protein: A8MUA0

Putative UPF0607 protein ENSP00000381514, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MUA0 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MUA0 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MUA0 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MUA0 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MUA0 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MUA0 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MUA0 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MUA0 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MUA0 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MUA0 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MUA0 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MUA0 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MUA0 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MUA0 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MUA0 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MUA0 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MUA0 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MUA0 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MUA0 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MUA0 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MUA0 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MUA0 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MUA0 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MUA0 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MUA0 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MUA0 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MUA0 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MUA0 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MUA0 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MUA0 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MUA0 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A8MUA0 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A8MUA0 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A8MUA0 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
A8MUA0 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
A8MUA0 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A8MUA0 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A8MUA0 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A8MUA0 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A8MUA0 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
A8MUA0 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A8MUA0 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A8MUA0 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
A8MUA0 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A8MUA0 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A8MUA0 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
A8MUA0 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
A8MUA0 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
A8MUA0 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
A8MUA0 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
A8MUA0 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
A8MUA0 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
A8MUA0 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
A8MUA0 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
A8MUA0 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
A8MUA0 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A8MUA0 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A8MUA0 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
A8MUA0 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
A8MUA0 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A8MUA0 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A8MUA0 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
A8MUA0 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
A8MUA0 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A8MUA0 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A8MUA0 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
A8MUA0 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A8MUA0 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
A8MUA0 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
A8MUA0 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A8MUA0 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A8MUA0 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A8MUA0 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A8MUA0 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
A8MUA0 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
A8MUA0 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
A8MUA0 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
A8MUA0 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
A8MUA0 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
A8MUA0 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
A8MUA0 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
A8MUA0 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
A8MUA0 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
A8MUA0 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A8MUA0 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
A8MUA0 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
A8MUA0 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
A8MUA0 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
A8MUA0 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A8MUA0 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
A8MUA0 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
A8MUA0 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A8MUA0 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
A8MUA0 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A8MUA0 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A8MUA0 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
A8MUA0 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A8MUA0 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A8MUA0 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A8MUA0 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms